Shigehiro Kuraku
Squalomix紹介記事
当研究室の主導する軟骨魚類DNA情報解析のための活動をSqualomix（すくあろみくす）と名付け、個別の生命現象に注目する共同研究者だけでなく、大学附属の臨海実験所や水族館とも連携したコンソーシアムとして活動を行っています。...
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Shigehiro Kuraku
2022年2月13日
EBPの進捗
先月1月18日に、当研究所のInformationのページに、EBP（Earth BioGenome Project、地球バイオゲノムプロジェクト）について、下記のアナウンスを掲載いただきました。 「地球バイオゲノムプロジェクト」の進捗について科学雑誌「PNAS」で紹介され...
Shigehiro Kuraku
2022年2月12日
MAFFT～aLeaves
日本発のアラインメントプログラムMAFFTの最初の論文から、今年でちょうど20年です。阪大・微生物研究所の加藤和貴博士が中心となって開発そして改良されてきました。 私は、神戸理研時代の初期に、aLeaves（エイリーヴズ）というツールをつくりました。データベース横断的に動物...
Shigehiro Kuraku
2022年2月3日
新しいインタビュー記事
研究所の広報チームのご尽力で、これまでの研究活動を振り返ったインタビューを掲載いただきました。今までどこでも取り上げられていないエピソードなど沢山含めたつもりです。 ライターの方とは、以前ドイツ時代に一緒にお仕事させていただいた間柄という、なんとも感慨深いインタビューでした...
Shigehiro Kuraku
2022年1月5日
気軽に院の見学会へ
2月16日に、遺伝研で研究する大学院生が所属する総合研究大学・遺伝学専攻のオンライン見学会が行われます。 オンライン見学会の公式ページはこちら 大学院・専攻についての全体的な紹介と、研究室ごとの紹介の両方を行います。意志がどのくらい固まっているかは関係なく、ご興味お持ちでし...
Shigehiro Kuraku
2022年1月2日
トラ年のはじめは
新年あけましておめでとうございます。寅年がはじまりました。研究室の装備もメンバーも揃うのはこれからですが、三島の研究室が正式にスタートしてはじめての年始です。 サメの種類で言うと、「トラ」といえば、Tiger＋Shark＝イタチザメ Galeocerdo cuvier...
Shigehiro Kuraku
2021年11月20日
一般向け紹介
11月20日(土）に開催されましたオンラインイベント『国立遺伝学研究所ONLINE公開講演会』にて使用しました研究室公開資料を下記に貼り付けておきます。
Shigehiro Kuraku
2021年11月20日
分生フォーラム企画
第44回日本分子生物学会年会にて、フォーラム「生物多様性ゲノミクスの世界潮流ー日本からどういったインプットが可能か？」を開催します。オンライン・対面どちらでも是非ご参加ください。 キーワード：ゲノム情報 生物多様性 EBP 気候変動 保全...
Shigehiro Kuraku
2021年11月17日
5/12の講演動画
5月12日にオンラインで行われました 2021 PacBio Japan Virtual User Group Meeting での講演『生物多様性ゲノム学への招待：現代のDNAシークエンスの愉しみに浸る』（演者、工樂 樹洋）の動画を公開しました。...
Shigehiro Kuraku
2021年10月29日
ラブカ
この三文字でピンとくる方、少なくないでしょう。カグラザメ目（Hexanchiformes）のサメの一種で、以前より「生きた化石」と形容されてきました。 この生物については、個体数減少の懸念にも配慮しつつ、アクアマリンふくしまと東海大海洋科学博物館により共同で調査・研究が行わ...
Shigehiro Kuraku
2021年10月17日
NIG-JOINT募集開始
公募型共同研究「NIG-JOINT」について、新たに募集要項が公開され、募集が開始となりました。 詳しくは要項に記されていますが、当研究室では、分子進化学的見地からのゲノム情報の取得や利用、そして遺伝子の分子系統解析のためのノウハウ共有を中心とした内容について受入れが可能で...
Shigehiro Kuraku
2021年10月13日
11/13にオンライン講演
11月13日（土）に日本動物学会近畿支部のイベントでオンライン講演させていただくことになりました。 公開講演会（13：30～14：45） 工樂 樹洋（国立遺伝学研究所） 「何故みなと神戸でサメの研究に取り組んできたのか？ー水族館との連携からゲノム進化まで」...
Shigehiro Kuraku
2021年9月30日
研究室配属前に
非常勤講師としての大学院生向け「科学英語」の講義を3年続け、今年度の分を終えました。まさに自分のためにもなる経験でした。一般論として書きますが、科学英語を学ぶ前に、「英語（高校までの知識を前提として英会話と英作文）」と「（日本語でよいから）科学のための文章の書き方」を学んで...
Shigehiro Kuraku
2021年9月15日
9/22にセミナー
9月22日に中谷洋一郎博士（大阪大学医学部）のセミナーを企画しました。詳しくは研究所公式HPをご覧ください。所外から希望される方も聴講いただくことが可能です。工樂まで直接メールでご連絡ください。 セミナーでは、最近筆頭著者として出されたこちらの論文についてご紹介いただける予...
Shigehiro Kuraku
2021年8月31日
8月30日に
サメ・エイの発生学研究にゲノム解析が果たしうる役割について、独自の視点で総説を書きました。研究所の公式ページにて、その元となる考えについて簡単に紹介しています。研究所の公式ページにこういった記事を出させていただくのは当研究室としては初めてになります。...
Shigehiro Kuraku
2021年8月31日
技術の敷居を下げる
いわゆる超並列型DNAシークエンスにもとづく情報取得のためのサンプル調製の難易度を考えたとき、Hi-Cはもっとも難しい部類に入ると思います。キットや丸投げ受託プランもありますが、総じて膨大な費用がかかり、またサンプルに合わせた手順の最適化がしにくいのが実状だと思います。とく...
Shigehiro Kuraku
2021年8月5日
共同研究はご相談を
当研究室に限った情報ではありませんが、共同研究のご相談の際にご考慮いただくとプラスになるかもしれない機会が用意されていますので、ご紹介いたします。 NIG-JOINT・共同研究A/B 詳しくは要項に記されていますが、当研究室では、分子進化学的見地からのゲノム情報の取得や利用...
Shigehiro Kuraku
2021年7月21日
年内の国内学会
年末までの国内学会参加・講演予定をお知らせしておきます。どれもオンライン学会になってしまいましたが、それぞれに新しい話題を提供したいと思い、意気込んでいます。 8月、日本進化学会 シンポジウム「染色体進化研究の新たなる展開」にて講演...
Shigehiro Kuraku
2021年7月10日
責任著者どう決める？
先日のブログ記事で少しだけ触れた責任著者について、これまでいろいろなケースがありました。研究室の一メンバーとして体験したことや、研究室のリーダーとして判断してきた実例を軽く書いてみます。 私が博士課程の主要な期間に在籍させていただいた理研の倉谷滋さんの研究室では、研究の着想...
Shigehiro Kuraku
2021年7月6日
日本発コンソ
「コンソ」と略して書いたのは、「コンソーシアム」のこと。先日、ヒトゲノム完全解読について、出版前の原稿が公表されましたが、取り組んだチームに日本人が一人も入っていない、ということで話題になっているようです。かつてはそれなりの立場を確保し、世界の舞台で役割を果たしていたこの国...
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