Shigehiro Kuraku
研究所で研究し学位
いうまでもないですが、研究所は研究をするところであり、大学で研究するのと大きく異なっているはずです。特色は遺伝研全体として大学院を紹介するサイトにまとめられています。一過的な風潮に流されず、また単に組織を回すためだけの活動に囚われずに、真に自由な発想に基づく研究が尊重される...
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Shigehiro Kuraku
- 10月23日
サンマのゲノム情報
「解読」などと大それた言い方は敢えてしません、大事なのはここからですので。今秋も話題のサンマ Cololabis saira について、まずはゲノム全体を読み取って分子レベルの様々な研究が色々な方面からスムーズに始められるように、ということで、DNA配列情報を取得しました。...
Shigehiro Kuraku
- 10月10日
Squalomix活動報告＠MBSJ
来る12月に神戸で開催される分子生物学会年会にて、Late-breaking Abstract (LBA)のポスター発表といいうかたちで、Squalomixコンソーシアムの活動を報告します。 ポスター番号：3P-053 発表日時：12月8日（金）13：45～14：45...
Shigehiro Kuraku
- 9月20日
Medaka Omics News 1
当研究室では、種が変わっても活かせるゲノム情報解析と公開のノウハウを生かして、さまざまな生物の研究に参加しています。メダカNBRPへの情報公開についての活動もそのひとつです。小型魚類研究MLから発信したニュースのバックナンバーを辿ることができるよう、ここに記録しておきます。...
Shigehiro Kuraku
- 9月18日
3' UTRが大事
シングルセル遺伝子発現解析のための簡便なシステムが登場してすでにもう久しく、かなり普及したといってよいのではないでしょうか。しかし、簡便になった分、システムの「クセ」に気を留めずに始める方も少なくないような気がします。ラフですが、「クセ」とその対応の仕方について下に簡単に記...
Shigehiro Kuraku
- 8月16日
高校生向け実習素材
先日、高校の生物の教師の方々が全国から集まる日本生物教育会（JABE）第77回全国大会にて研修を担当し、分子系統樹推定を助けるツールaLeavesを紹介するとともに、授業への取り込み方のアイデアについて参加者の方々と意見交換をさせていただきました。最新の教科書では、遺伝子や...
Shigehiro Kuraku
- 7月22日
希少生物の全ゲノム情報：日本版
（リリース後に誤字訂正などのため更新） 先日、和色（Washoku）バイオゲノムコンソーシアムについて少し書きました。その活動のモチベーションのひとつである、日本で対策が必要と考えられる希少生物の全ゲノム情報に関して、現在どの生物種で整備がどのくらい進んでいるかを一覧表示し...
Shigehiro Kuraku
- 6月14日
WBC !!
先日、東京での対面企業セミナーの際に話に出しましたWashoku (和色) BioGenome Consortium（そう、WBC！）について、その精神を文字にしました。同志からの感想をいただいているところですが、あくまでも仮のものとしてここに張り付けておきます。...
Shigehiro Kuraku
- 6月11日
講演等の予定
現在わかっているものについて講演等の予定を記しておきます（更新 10月10日）。 6月14日 21時～ Scienc-omeオンラインセミナー （会員制） 「サメ研究で鍛えるゲノム時代の生物多様性リテラシー〜サメの分子進化学が照らす我々の祖先と海洋生物のくらし 〜」...
Shigehiro Kuraku
- 3月25日
三島駅から-ご来訪ガイド
新幹線の駅から、たった20分で正面玄関に着いてしまう。それが研究以外で魅力的だと私が思っている、遺伝研のよいところのひとつです。私が書くのも変かもしれませんが、研究室や研究所をご訪問される方へちょっとしたガイドを記しておきます。私自身、もっと早めに知っていたら、と思ったこと...
Shigehiro Kuraku
- 3月25日
最近の論文発表
ここでの発信が追い付いていませんでしたので、最近の論文発表について紹介しておきます。 Egg Yolk Protein Homologs Identified in Live-Bearing Sharks: Co-Opted in the...
Shigehiro Kuraku
- 3月22日
メダカの学校
タイトルはちょっとふざけただけで、まじめな内容です。明日、NBRPのメダカのプロジェクトの中でゲノム情報の提供を担当している当研究室の今年度の活動を報告するオンラインセミナーを行います。小型魚類研究者の間では、すでに連絡が回っていると思います。...
Shigehiro Kuraku
- 3月9日
最近の一般向け諸々
2022年8月 令和4年度 沼津市立図書館夏休み子ども講座 「海のいきものを調べるしごと −DNAと進化のはなし−」講演者 工樂 樹洋 2022年11月 国立遺伝学研究所 ONLINE公開講演会2022 「DNA情報から見る動物の進化」講演者 工樂 樹洋...
Shigehiro Kuraku
- 2月11日
AGBT23
米国でいつもこのくらいの時期に行われる会議 AGBT。実際に使えるかはよく分かりません が、興味を惹く情報や発表がいろいろありました。Twitterでは #agbt23 でフォローできます。
Shigehiro Kuraku
- 2月8日
Jxivに技術的総説
ゲノムサイズ測定とHi-Cスキャフォルディングを主眼にした技術的な記事を、神戸のラボのメンバーと執筆し、投稿準備中の原稿をJSTが運営しているプレプリントサーバJxivにて公開しました。 この記事の中で、生細胞を必要としないゲノムサイズ測定のためのプロトコルを紹介しています...
Shigehiro Kuraku
- 1月13日
生命情報系の人材募集
研究室で進める脊椎動物の生命情報解析およびデータ提供のための情報基盤整備を担う人材を募集しています。自身の研究プロジェクトを進めていただくことも可能です。 詳細は下記のリンク先をご覧ください。 特任研究員 あるいは 技術補佐員 （遺伝研公式ホームページの求人案内）...
Shigehiro Kuraku
- 2022年12月8日
サメ成体解剖会
以前、幼魚の解剖について呼びかけをしていましたが、今回は成魚についてです。 イヌザメ成魚 オス シロザメ成魚 メス 学術研究に使用可能な個体です。静岡県内で解剖を計画しており、貴重な生物資源を最大限に活用するために、興味が重複しない範囲で、立ち合いおよび組織分与のご希望を受...
Shigehiro Kuraku
- 2022年11月25日
メダカNBRP
当研究室で、ナショナルバイオリソースプロジェクト（NBRP）として、メダカのゲノム情報の整備とユーザーへの利用を促進しています。分担として加わって1年目の成果となります既存情報を集積したウェブサーバの公開にあわせ、来週幕張で行われます第45回日本分子生物学会年会において、こ...
Shigehiro Kuraku
- 2022年11月3日
冬からの講演予定
工樂のここからの講演予定です。随時更新していきます。 12月10日 令和4年度 水産育種研究会 定例シンポジウム 東大水産実験所にて 演題名「軟骨魚類と条鰭魚類を分けるゲノムの性質の探究」 1月24～27日 Yamada Conference LXXV Origin of...
Shigehiro Kuraku
- 2022年10月27日
求人（技術系・情報系）
技術系・情報系の求人のお知らせです。 研究室で進める動物の生命情報解析およびデータ提供のための情報基盤整備を担う人材を募集しています。自身の研究プロジェクトを進めてもらうことも可能です。 詳細は下記をご覧ください。 特任研究員 あるいは 技術補佐員...
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