Medaka Omics News 7

Shigehiro Kuraku
2月27日
読了時間: 2分

更新日：3月2日

2週続けてのメダカ発信は初めてです。岡崎でのユーザーミーティングがあらゆる立場の方にとって有意義な集まりになることを願っています。当方も貴重な時間をいただいて活動紹介いたします。

なお、メダカのT2Tゲノム配列は東大の鈴木慶彦先生をはじめとする森下真一先生のグループのご尽力により読み取られ、またご厚意により論文出版前に公開されたものです。当該ゲノム情報を利用した成果の発表の際には、（MedakaBaseを介したものであってもMedakaBaseへのクレジットだけでなく）上記オリジナルなゲノム情報への、然るべき形でのクレジットをよろしくお願いいたします。

---

Medaka Omics News by NBRP - 2026年2月27日

メダカNBRP 生命情報チームによる活動をお伝えします。

▲ MedakaBaseへ、メダカHd-rR, HSOK, HNI系統の最新ゲノムアセンブリ(v3.1)を

追加しました。当チームで推定した遺伝子モデルをそれぞれ掲載し、

うちHd-rRについては、それに加えてNCBIの標準アノテーションパイプライン

EGAPによる遺伝子モデルも掲載しています。

▲ NCBIで公開されたメダカv3.1アセンブリと遺伝子モデル、そして

それに基づく有用機能については先週発信した本ニュース前号(Vol. 6)を

ご参照ください。

▲ 新しいアセンブリに付随したRNA-seqデータやChIP-seqはJBrowse上で

既に閲覧いただけますが、野生由来系統の変異の表示はまだ準備できていません。また、今回のMedakaBaseの更新に伴って、TOPページにおけるワード検索機能を