当研究室では、（前身の神戸理研・分子配列比較解析チームの時代から）おもに脊椎動物のゲノム進化の変遷を推定するため、偏りのない比較を実現すべく大規模配列データが乏しい生物での新規情報取得にも（ラボ内で活動していたいわゆるNGSコア施設の技術的ノウハウを鍛え、そして駆使しながら）力を入れてきました。唐突ですが、ここで、爬虫類ソメワケササクレヤモリのゲノム関係の情報をまとめておきます。 紹介記事 ・理研プレスリリース「爬虫類ソメワケササクレヤモリの全ゲノム解読－マウス、ニワトリに並ぶ有用な研究対象として期待－」 （2018年4月、下記ゲノムアセンブリ初版に付随した論文出版に際して） ・雑誌『実験医学』に記事「オミクス解析にも応える実験動物ソメワケササクレヤモリ」 （2018年6月、 連載「私の実験動物、やっぱり個性派です！」の一部として） ・理研プレスリリース「新たな実験動物としてのソメワケササクレヤモリ－哺乳類の比較対象に適した爬虫類の遺伝子をカタログ化－」 （2015年11月、下記トランスクリプトーム解析出版に伴い発出） ・理研プレスリリース「遺伝

先日の分子生物学会フォーラムでは、往々にしてどこにも書かれていない技術情報に光をあてました。より滑らかに多様な生物でゲノムワイドな分子レベルの解析が進められることを思い描いて、Biodiversity Genomicsまわりで同じくあまり文字に記されない汎用的かつ重要なことをこれまで敢えて度々発信してきました。網羅できていないと思いますが、それらのうち主なものをまとめて紹介しておきます。中でも、とっかかりとしての敷居の低い記事としては、下記の＊印をつけたものを推しておきます。 ゲノムサイズ測定 　qPCRプロトコルsQuantGenome 　付随した論文（Kadota et al., F1000Res 2023） Hi-Cスキャフォルディング 　神戸理研時代に発信したiconHi-C（アイコニック）プロトコル・論文（Kadota et al., 2020） 　英語総説 （Yamaguchi et al., Mol Ecol 2021） 　日本語総説 (工樂ら, 2023)＊ Completeness assessment周辺情報...

以前ここで「あくまでも出発点」として取り上げた、サンマの論文が出版されました。 Chromosomal DNA sequences of the Pacific saury genome: versatile resources for fishery science...

「解読」などと大それた言い方は敢えてしません、大事なのはここからですので。今秋も話題のサンマ Cololabis saira について、まずはゲノム全体を読み取って分子レベルの様々な研究が色々な方面からスムーズに始められるように、ということで、DNA配列情報を取得しました。...