Shigehiro Kuraku
Medaka Omics News 1
当研究室では、種が変わっても活かせるゲノム情報解析と公開のノウハウを生かして、さまざまな生物の研究に参加しています。メダカNBRPへの情報公開についての活動もそのひとつです。小型魚類研究MLから発信したニュースのバックナンバーを辿ることができるよう、ここに記録しておきます。...
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Shigehiro Kuraku
2023年9月18日
3' UTRが大事
シングルセル遺伝子発現解析のための簡便なシステムが登場してすでにもう久しく、かなり普及したといってよいのではないでしょうか。しかし、簡便になった分、システムの「クセ」に気を留めずに始める方も少なくないような気がします。ラフですが、「クセ」とその対応の仕方について下に簡単に記...
Shigehiro Kuraku
2023年8月16日
高校生向け実習素材
先日、高校の生物の教師の方々が全国から集まる日本生物教育会（JABE）第77回全国大会にて研修を担当し、分子系統樹推定を助けるツールaLeavesを紹介するとともに、授業への取り込み方のアイデアについて参加者の方々と意見交換をさせていただきました。最新の教科書では、遺伝子や...
Shigehiro Kuraku
2023年7月22日
希少生物の全ゲノム情報：日本版
（リリース後に誤字訂正などのため更新） 先日、和色（Washoku）バイオゲノムコンソーシアムについて少し書きました。その活動のモチベーションのひとつである、日本で対策が必要と考えられる希少生物の全ゲノム情報に関して、現在どの生物種で整備がどのくらい進んでいるかを一覧表示し...
Shigehiro Kuraku
2023年6月14日
WBC !!
先日、東京での対面企業セミナーの際に話に出しましたWashoku (和色) BioGenome Consortium（そう、WBC！）について、その精神を文字にしました。同志からの感想をいただいているところですが、あくまでも仮のものとしてここに張り付けておきます。...
Shigehiro Kuraku
2023年6月11日
講演等の予定
現在わかっているものについて講演等の予定を記しておきます（更新 10月10日）。 6月14日 21時～ Scienc-omeオンラインセミナー （会員制） 「サメ研究で鍛えるゲノム時代の生物多様性リテラシー〜サメの分子進化学が照らす我々の祖先と海洋生物のくらし 〜」...
Shigehiro Kuraku
2023年3月25日
三島駅から-ご来訪ガイド
新幹線の駅から、たった20分で正面玄関に着いてしまう。それが研究以外で魅力的だと私が思っている、遺伝研のよいところのひとつです。私が書くのも変かもしれませんが、研究室や研究所をご訪問される方へちょっとしたガイドを記しておきます。私自身、もっと早めに知っていたら、と思ったこと...
Shigehiro Kuraku
2023年3月25日
最近の論文発表
ここでの発信が追い付いていませんでしたので、最近の論文発表について紹介しておきます。 Egg Yolk Protein Homologs Identified in Live-Bearing Sharks: Co-Opted in the...
Shigehiro Kuraku
2023年3月22日
メダカの学校
タイトルはちょっとふざけただけで、まじめな内容です。明日、 NBRP のメダカのプロジェクトの中でゲノム情報の提供を担当している当研究室の今年度の活動を報告するオンラインセミナーを行います。小型魚類研究者の間では、すでに連絡が回っていると思います。 下記、...
Shigehiro Kuraku
2023年3月9日
最近の一般向け諸々
2022年8月 令和4年度 沼津市立図書館夏休み子ども講座 「海のいきものを調べるしごと −DNAと進化のはなし−」講演者 工樂 樹洋 2022年11月 国立遺伝学研究所 ONLINE公開講演会2022 「DNA情報から見る動物の進化」講演者 工樂...
Shigehiro Kuraku
2023年2月11日
AGBT23
米国でいつもこのくらいの時期に行われる会議 AGBT。実際に使えるかはよく分かりません が、興味を惹く情報や発表がいろいろありました。Twitterでは #agbt23 でフォローできます。
Shigehiro Kuraku
2023年2月8日
Jxivに技術的総説
ゲノムサイズ測定とHi-Cスキャフォルディングを主眼にした技術的な記事を、神戸のラボのメンバーと執筆し、投稿準備中の原稿をJSTが運営しているプレプリントサーバJxivにて公開しました。 この記事の中で、生細胞を必要としないゲノムサイズ測定のためのプロトコルを紹介しています...
Shigehiro Kuraku
2023年1月13日
生命情報系の人材募集
研究室で進める脊椎動物の生命情報解析およびデータ提供のための情報基盤整備を担う人材を募集しています。自身の研究プロジェクトを進めていただくことも可能です。 詳細は下記のリンク先をご覧ください。 特任研究員 あるいは 技術補佐員 （遺伝研公式ホームページの求人案内）...
Shigehiro Kuraku
2022年12月8日
サメ成体解剖会
以前、幼魚の解剖について呼びかけをしていましたが、今回は成魚についてです。 イヌザメ成魚 オス シロザメ成魚 メス 学術研究に使用可能な個体です。静岡県内で解剖を計画しており、貴重な生物資源を最大限に活用するために、興味が重複しない範囲で、立ち合いおよび組織分与のご希望を受...
Shigehiro Kuraku
2022年11月25日
メダカNBRP
当研究室で、ナショナルバイオリソースプロジェクト（NBRP）として、メダカのゲノム情報の整備とユーザーへの利用を促進しています。分担として加わって1年目の成果となります既存情報を集積したウェブサーバの公開にあわせ、来週幕張で行われます第45回日本分子生物学会年会において、こ...
Shigehiro Kuraku
2022年11月3日
冬からの講演予定
工樂のここからの講演予定です。随時更新していきます。 12月10日 令和4年度 水産育種研究会 定例シンポジウム 東大水産実験所にて 演題名「軟骨魚類と条鰭魚類を分けるゲノムの性質の探究」 1月24～27日 Yamada Conference LXXV Origin of...
Shigehiro Kuraku
2022年10月27日
求人（技術系・情報系）
技術系・情報系の求人のお知らせです。 研究室で進める動物の生命情報解析およびデータ提供のための情報基盤整備を担う人材を募集しています。自身の研究プロジェクトを進めてもらうことも可能です。 詳細は下記をご覧ください。 特任研究員 あるいは 技術補佐員...
Shigehiro Kuraku
2022年9月28日
サンマ研究、まずゲノム
当研究室としては初めて、サンマ Cololabis saira の研究に着手しました。人工繁殖に成功しているアクアマリンふくしまとの共同研究です(BuNaに掲載の記事）。最近の不漁続きもあり注目の集まる食用魚として（つい先週出たYahooニュース）、野外での繁殖生態を明らか...
Shigehiro Kuraku
2022年9月10日
10月5日にセミナー
10月5日（水）の15時から、OIST・植物エピジェネティクスユニット（佐瀬 准教授）所属の研究者Jérémy Berthelier博士によるオンラインセミナーを実施します。詳細はこちらをご覧ください。Jérémyさんはトランスポゾン検出プログラムPiRATEの開発者です。...
Shigehiro Kuraku
2022年9月7日
組織超えたJournal Club
以前Twitterでアナウンスしましたが、ラボや組織の枠に囚われないジャーナルクラブ（参加者の共通の興味に訴える出版論文を選んで紹介する集まり）を開いています。月一回、夕方にオンラインで開催しています。所外からも参加いただけますので、ご希望ありましたら工樂までご連絡ください...
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