当研究室が分担機関として関わっているメダカのNBRPについての最新情報です。
Medaka Omics News by NBRP - 2023年12月4日
メダカNBRP 生命情報チームによる活動をお伝えします。
▲ ウェブサーバMedakaBaseのマニュアルを作成しました。下記でご覧いただけます。
MedakaBaseのトップページからリンクしています。
▲ 12月6～8日に神戸で行われる分子生物学会年会のNBRPブースにて、
12月7日の15〜16時にメダカのオミクス解析についての個別相談を受け付けます。
ただし、下記から事前予約された方を優先させていただきます。
▲同じく分子生物学会年会において、 12月8日13:20から10分間、NBRPブースにて
MedakaBaseを含むゲノムリソースの紹介をします。
▲ MedakaBaseでのBLAST検索において、複数のゲノム配列データベースを選択すると
検索結果の一部しか表示されない問題が起きており、11月下旬にこの問題を
解決しました。心当たりのある方は、お手数ですが、再度ご検索ください。
▲Oryzias属のアウトグループとなるサンマ Cololabis saira のゲノム情報を独自に取得し
公開しています。
各種配列情報へのリンク https://treethinkers.nig.ac.jp/saira/
▲ 11月16日に、特任研究員の森上賢治さんが研究会「アノテーソン2023」にて
シングルセル解析を目的として3'UTR情報の付加について話題提供しました。
こちらからスライドをご覧いただけます。
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NBRPメダカ 生命情報チーム（国立遺伝研 分子生命史研究室）
Twitterアカウント https://twitter.com/NbrpMedakaOmix
MedakaBase https://medakabase.nbrp.jp/
Medaka Omics Reference https://github.com/Squalomix/medaka-annex
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