Medaka Omics News 5
- Shigehiro Kuraku
- 47 分前
- 読了時間: 2分
Medaka Omics News by NBRP - 2025年10月23日
メダカNBRP 生命情報チームによる活動をお伝えします。
▲ ウェブサーバMedakaBase等、当方の活動産物を紹介した記事が
DNA Research誌にオンライン掲載されました。
近縁2種のゲノム情報とUTR情報を追加した遺伝子モデルの増強版(ver.4)を
新規に報告しています。成果発表の際にMedakaBase等の情報源の裏付けが
必要な場合など引用いただけます。
（プレプリントの時点から論文タイトルが若干変更されました）
▲ MedakaBase内のゲノムブラウザで、公開済み データに基づくCTCFの
ChIP-seqトラックを表示することが可能となりました。
(ページ左のメニュー下部の'04 ChIP-seq'から選択)
再現性のあるデータとして論文等で参照いただきやすいよう、すでに
表示可能にしていたRNA-seqデータとともに、マニュアル（日・英とも）
にデータ処理手順を記載しました。
▲ 「変わりゆく小型魚類ゲノムリソース事情」と題してMedakaBase等
小型魚類ゲノムリソース・ツールを紹介したスライドを公開しました。
今年5月30日に奈良先端大で開催された関西おさかな勉強会において
発表に使用した スライドの一部です。
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NBRPメダカ 生命情報チーム（国立遺伝研 分子生命史研究室）
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Medaka Omics Reference https://github.com/Squalomix/medaka-annex
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