Medaka Omics News 8 & 9
- Shigehiro Kuraku
- 7月21日
- 読了時間: 2分
Medaka Omics News by NBRP - 2026年7月21日
▲ 引き続き、セキュリティ強化の必要からくるサーバの整備のため、MedakaBaseを休止しております。復旧へ向けて対策を講じておりますので、ご不便をどうかお許し下さい。
▲ メダカHd-rRのT2Tアセンブリにもとづく3’UTR補強版遺伝子モデルver.5を新たに作出し、FigShareよりダウンロードできるようにしました。
10X Genomicsのsc/snRNA-seqデータ解析の際に利用いただけるほか、お手元のゲノムブラウザで表示いただけます。
▲メダカHd-rRのT2TゲノムアセンブリとHSOKおよびHNIのT2Tに準ずるアセンブリを報告した論文が出版されました。
当該データご利用の際にはこの論文を引用ください。この中で、当チームは遺伝子推定を担当しました。
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Medaka Omics News by NBRP - 2026年4月14日
メダカNBRP 生命情報チームによる活動をお伝えします。
▲ セキュリティ強化を目的としたサーバー整備のため、3月中旬よりMedakaBaseの運用を一時休止しております。一日も早い復旧を目指しております。ご利用の皆様にはご迷惑をおかけし、誠に申し訳ございません。
▲ 休止中の措置として、最新ゲノムアセンブリ(v3.1)についてJBrowseで閲覧可能だったデータ（遺伝子モデル、RNA-seq、ChIP-seq）をダウンロードできるようにしました（リンク）。これまで公開していたUTR補強版遺伝子モデル（リンク）と同様に、お手元のゲノムブラウザ等に読み込むなどし表示・解析いただけます。
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NBRPメダカ 生命情報チーム（国立遺伝研 分子生命史研究室）
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